在日本定居或长期生活的移民群体中，税收制度是影响生活规划和经济决策的核心问题之一。日本的税收体系以累进性和覆盖全面性为特征，既包括国家层面的直接税与间接税，也涉及地方自治体征收的多种税目，不同身份的居民承担的税务责任差异显著。
对于移民而言，纳税义务由其居留身份决定。持有"非永住者"身份的外国人（居住未满5年）仅对日本境内的收入征税，而"永住者"和居住满5年的外国人将被归类为税务居民，须对全球范围内的收入进行申报。这种差异直接影响着跨国工作者的资产配置策略——例如，海外房产租金或投资收益可能面临两国税务管辖权的重叠。为避免双重征税，日本已与68个国家和地区签订税收协定，允许抵免部分境外已缴税款，但纳税人需要主动提交《外国税额控除》申报表。
在具体税种方面，个人所得税采用超额累进税率制度，年收入195万日元以下适用5%税率，超过4000万日元的部分税率升至45%。值得注意的是，日本采用"源泉征收"与"年末调整"相结合的征收方式，工薪族每月工资已由企业代扣税费，而自由职业者或经营所得者需自行完成确定申告。居民税构成另一项重要支出，包括均摊的"均等割"（约5000日元/年）和按收入计算的"所得割"（约10%税率），其特殊之处在于依据前年度收入计算，导致新移民首年税负较轻而次年开始显著增加。
消费税的存在持续抬升生活成本，自2019年上调至10%后，除生鲜食品和订阅报刊外，多数商品服务均适用标准税率。房产相关税费构成移民的长期负担，购买房产时需缴纳3-4%的购置税，持有期间每年缴纳评估价1.4%的固定资产税，遗产继承时最高税率可达55%。日本税务机关的审查力度近年来持续加强，2022年东京国税局查处海外资产隐瞒申报案件同比增长37%，凸显税务合规的重要性。
面对复杂的税制，新移民普遍采取两种合规策略：利用扣除制度降低税基（包括医疗费、保险、捐赠等14类扣除项），或通过设立合同会社等法人结构将个人所得税率转换为15-23.2%的法人税率。专业税务士建议，年收入超过800万日元的群体可考虑法人化节税方案，但需平衡设立成本与节税效益。对于跨国资产持有者，提前进行遗产税模拟计算和海外资产透明化申报已成必要准备。
